ROME

ROME - Réseau d'Observatoires pour la recherche en Microbiologie Environnementale intégrée.

Partenaires : DYNECO (Coordination Raffaele Siano) ; LERs; LSEM

Objectifs : observation intégrée de la microbiologie du littoral métropolitain

  • analyses massives de l’ADN et de l’ARN environnemental
  • analyses des apports des bassins versants en évaluant les voies d’entrée de la contamination d’origine fécale animale ou humaine.
  • veille d’émergence de micro-organismes pouvant présenter un risque pour la santé humaine ou animale.

Activités d’ASIM dans ROME

  • Participation au comité scientifique
  • Étudier la distribution d’organismes pathogènes pour les animaux aquatiques
  • Analyse des séquençages de viromes

ROME –COLORS 

  • Projet 1 an piloté par LER Concarneau
  • Testage de PacBio et Nanopore sur les échantillons ROME

Activités liées à ROME

  • Dans le cadre du LRUE, Comparaison des approches ciblées versus métabarcoding pour la détection d‘organismes pathogènes