ROME (depuis 2020)

ROME - Réseau d'Observatoires pour la recherche en Microbiologie Environnementale intégrée.

Partenaires : DYNECO (Coordination Raffaele Siano) ; LERs; LSEM

Objectifs : observation intégrée de la microbiologie du littoral métropolitain

• analyses massives de l’ADN et de l’ARN environnemental

• analyses des apports des bassins versants en évaluant les voies d’entrée de la contamination d’origine fécale animale ou humaine.

• veille d’émergence de micro-organismes pouvant présenter un risque pour la santé humaine ou animale.

Activités d’ASIM dans ROME

• Participation au comité scientifique

• Étudier la distribution d’organismes pathogènes pour les animaux aquatiques

• Analyse des séquençages de viromes

ROME –COLORS 

• Projet 1 an piloté par LER Concarneau

• Testage de PacBio et Nanopore sur les échantillons ROME

Activités liées à ROME

• Dans le cadre du LRUE, Comparaison des approches ciblées versus métabarcoding pour la détection d‘organismes pathogènes