ROME-COLOR (2022-2024)

ROME-COLOR - "Comparaison de méthodes de séquençage long reads pour les études de communautés par approche métabarcoding dans le cadre de ROME"

Coordinateur & Partenaires

Type de projet

Années

Référent ASIM

ASIM – SEBIMER – PELAGOS – LER-BO

Ifremer

2022-2024

Germain Chevignon

Objectifs :

  • Évaluer les technologies de séquençage long read dans le cadre d’analyses metabarcoding 16S et 18S sur des échantillons ROME
  • Les technologies testées sont le (PacBio) et le Nanopore
  • Adaptation du pipeline SAMBA pour le long read