Méthodes diagnostiques

Des protocoles pour la recherche de différents agents infectieux de mollusques dont les agents réglementés sont disponibles sur le site du LRUE https://www.eurl-mollusc.eu/SOPs

 

Ouverture et examen macroscopique des coquillages

application/pdf Ouverture, rappels anatomiques et examen macroscopique des mollusques marins

 

Recherche du virus OsHV-1 et de la bactérie Vibrio aestuarianus par PCR temps réel

  • Préparation des échantillons

 application/pdf Réception et préparation des échantillons de mollusques pour des analyses de PCR temps réel

 

  •   Extraction d’ADN

Deux protocoles d’extraction sont disponibles et utilisent le QIAamp® DNA Mini Kit (QIAGEN).

 application/pdf Extraction de l'ADN des tissus de bivalves marins

 

  •   Détection du virus OsHV-1 par PCR temps réel

Deux méthodes peuvent être utilisées pour détecter le virus OsHV-1 :

 - PCR temps réel SYBR®Green OsHV-1 (adaptée de Pépin et al. 2008) 

application/pdf Détection du virus OsHV-1 par PCR en temps réel SYBR Green

 - PCR temps réel TaqMan® (adaptée de Martenot et al. 2010)

application/pdf Détection du virus OsHV-1 par PCR en temps réel TaqMan

Les laboratoires agréés ou reconnus sont libres d’utiliser l’une ou l’autre de ces méthodes.

 

  • Détection de la bactérie Vibrio aestuarianus par PCR temps réel

-  PCR temps réel TaqMan® (adaptée de Saunier et al. 2009)

 application/pdf Détection de la bactérie Vibrio aestuarianus par PCR en temps réel TaqMan

 

Recherche de bactéries appartenant au genre Vibrio

Mise en culture, isolement et caractérisation par PCR en temps réel multiplex de certaines espèces de Vibrio

application/pdf Isolement et caractérisation des souches de Vibrio par PCR multiplex